Chargé de recherche/ post-doctorant en épidémiologie et santé des élevages
ENVT
Toulouse (31)
En contrat uniquement
À savoir avant de postuler
- Diplôme : Doctorat/diplômes équivalents
- Anglais (lu, technique)
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L'offre en bref
- Niveau
- Catégorie A · CadrePostes de cadre. Niveau licence (bac+3) en général.
- Accès
- En contrat uniquementRecrutement par contrat, sans concours
- Contrat
- CDD de 6 mois
- Diplôme demandé
- Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
Vos missions
- Mettre en œuvre et optimiser une stratégie d’échantillonnage, intégrant notamment des prélèvements environnementaux, adaptée à la détection précoce des agents pathogènes en pisciculture, et plus particulièrement des virus
- Analyser les données métagénomiques
- Comparer les méthodes de préparation des acides nucléiques et de séquençage dans le cadre de la détection métagénomique à haut débit
- Participer à la définition d’une surveillance sensible, robuste et opérationnelle applicable aux élevages piscicoles
- Valoriser les résultats obtenus, notamment par la participation à la rédaction de publications scientifiques, la préparation de communications et la contribution aux rapports de recherche
- Participer au projet PRISM-E2 au sein de l’UMR 1225 en lien avec les cadres scientifiques de l’équipe VIRAL
- Participer à l’organisation et à la réalisation des campagnes d’échantillonnage sur les sites piscicoles
- Comparer les performances de détection d’agents pathogènes modèles en fonction du type de matrice, de la date de prélèvement, de la stratégie d’extraction et d’enrichissement des acides nucléiques des agents pathogènes et des techniques de séquençage haut-débit
- Mettre en relation les résultats moléculaires obtenus avec les données zoosanitaires et zootechniques des élevages
- Participer à l’harmonisation des protocoles de prélèvement, d’analyse et d’interprétation en collaboration avec les partenaires PRISM-E2
- Participer à la valorisation des résultats (publications scientifiques communication et contribution aux rapport de recherche)
- Participer à la démarche qualité de l’équipe
Profil recherché
- Connaissances en virologie générale
- Connaissances en virologie moléculaire et en biologie moléculaire
- Connaissances en bio-informatique
- Connaissance des méthodes de séquençage à haut débit
- Connaissance de la méthodologie scientifique
- Connaissance des filières piscicoles et des principaux agents pathogènes associés
- Maîtrise des outils de virologie moléculaire et biologie moléculaire
- Maîtrise ou expérience des approches de séquençage haut-débit
- Aptitude au développement d’outils moléculaires
- Capacité à analyser et interpréter les données scientifiques
- Capacité à travailler en interdisciplinarité
- Anglais scientifique écrit et oral
- Aptitude au travail en équipe
- Autonomie et capacité d’organisation
- Rigueur scientifique
Niveau d'études minimum : Doctorat/diplômes équivalents (niveau 8)
Qui recrute ?
ENVT
Ministère
- Fonction publique
- État
- Métier
- Experte / Expert en biologie - SVT
L'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse est un établissement public d'enseignement supérieur et de recherche dépendant du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.
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Créée en 1828, elle participe à la formation d'un quart des vétérinaires français, futurs cadres de haut niveau à profil scientifique, appelés à relever les enjeux de santé et de bien-être animal, mais aussi et surtout les grands défis de la santé publique actuels et futurs.
En matière de formation, l'établissement assure la formation initiale de près de 900 étudiants et diplôme 180 étudiants par an. L'École dispense en outre des actions de formations post universitaires diplômantes ou non destinées aux vétérinaires praticiens.
Descriptif du service
Ce poste s’inscrit dans le cadre du projet de recherche PRISM-E2 (PEPR Elevages durables), plus précisément dans le volet pisciculture. Le projet sera conduit en étroite collaboration entre l’équipe VIRAL de l’UMR 1225 IHAP et le laboratoire Anses de Plouzané.
Ce projet vise à développer et optimiser des stratégies de surveillance précoce des agents pathogènes en pisciculture, en testant notamment l’intérêt des prélèvements environnementaux et de la détection métagénomique par rapport à des méthodes plus conventionnelles.
La méthodologie sera développée en collaboration avec les autres partenaires de PRISM-E2 et notamment avec l’Ifremer, en charge de la partie conchyliculture. Ainsi, l’UMR 1225 IHAP recrute un chargé de recherche, ou une chargée de recherche, pour une durée de 12 mois afin de conduire ce projet.
La personne candidate évoluera en interaction étroite avec les pisciculteurs et les collaborateurs scientifiques.
Lieu de travail
23, Chemin des Capelles - 31300 Toulouse
Voir sur la cartePour postuler
- Documents à transmettre
- Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire
Date limite : 15 novembre 2026
Référence 2026-2442463 · Publiée le 23 octobre 2026 · Voir l'annonce officielle